学术经纬1月11日，复旦大学张永振教授与合作者悉尼大学EdwardHolmes教授在开放式病毒学网站向全世界发布了第一个新型冠状病毒原始基因组序列，这株病毒来自武汉在12月底收治的一位未知肺炎患者。几个月过去，随着疫情发展，更好的病毒基因组被测序。目前公开发表公布的SARS-CoV-2基因组序列早已有200个左右，来自世界多个地区的患者。

科学家们及时发布的病毒基因组序列数据，让临床测试以求较慢发展，也为研发疫苗和抗病毒药物奠下了基础。日前，张永振教授和Holmes教授在《细胞》上发表文章，对这些病毒基因组序列，以及其他目前未知的冠状病毒基因组序列的信息展开综述，协助我们附近新冠病毒起源与愈演愈烈的真凶。

野生动物交易市场起的起到文章中首先指出，武汉的华南海鲜市场在病毒的经常出现中起着最重要起到。研究作者曾在2014年前目睹在这一“湿货市场”看见过多种野生动物出售。他们认为，这样的市场给人畜共计患病获取了有效地的传播机制。

除了早期报告的COVID-19病例与该市场有最重要关联外，对市场上取得的“环境样本”做到基因组测序和系统发育分析表明，它们与最先一批武汉患者的病毒样本有“十分紧密的关系”。然而，由于早已无法必要获得华南海鲜市场的动物样本，很难具体这些环境样本中的病毒来自该市场的动物还是当时已在无意中传播的人。

换句话说，目前无法确认该市场在SARS-CoV-2的最初产生中明确扮演着的角色。▲研究作者数年前在武汉华南海鲜市场摄制到的照片冠状病毒在大自然中的趋同进化蝙蝠是多种冠状病毒的最重要“储存宿主物种”。

早期基因组较为的结果显示，来自云南找到的蝙蝠冠状病毒RaTG13与新冠病毒序列相近度低约96%。相比之下，新冠病毒与同归属于β冠状病毒的SARS病毒，在核苷酸水平上的相近度大约为79%。尽管序列相近，研究作者认为，新冠病毒与RaTG13在基因组中的许多关键特征上有所不同。其中最关键的差异是，新冠病毒在其S蛋白的两个亚基之间有一个类似蛋白酶切割成位点，有可能强化了新冠病毒的感染力。

这在SARS病毒中也是没的，而类似于的特征却在低致病性禽流感病毒株中不存在。此外，与SARS-CoV-2病毒感染人体细胞的能力有密切关系的另一个特点是其受体结构域，但这部分序列与蝙蝠冠状病毒RaTG13的相近度仅有为85%，并且其中最关键的6个氨基酸中，只有1个完全相同。作者还特别强调，在新冠病毒的S蛋白下有另一个类似的氨基酸序列放入，载于2019年从云南蝙蝠中找到的另一株冠状病毒，但在整个S蛋白的序列上，这株蝙蝠冠状病毒与SARS-CoV-2的相近度并不低，从这些信息可以显现出自然界中冠状病毒正在展开的趋同进化。药明康德内容团队制图研究作者指出，如果有更加多的蝙蝠样本，坚信可以找到与新冠病毒更加相似的蝙蝠冠状病毒。

一个关键的问题是：新冠病毒中特有的受体结构域变异、蛋白酶切割成位点，否可以在这些蝙蝠冠状病毒或其他动物中寻找。这个问题的答案将有助确认新冠病毒的起源。由于病毒如何从蝙蝠传遍人的中间过程目前还不明晰，在这篇文章中，两位研究者也对中间宿主是什么物种作出了猜测，并特别强调，对有野生动物交易的市场、人口密集地区的动物展开普遍取样是十分关键的措施。

文章中提到了探究穿山甲的研究论文，具体内容可参看学术经纬的涉及报导，在此不做到赘述。研究作者说道，“至关重要的是，对动物冠状病毒的监控不应还包括蝙蝠以外的动物，因为中间宿主的起到有可能十分最重要，这为病毒在人体内的传播获取了更加必要的途径。”人群中的不为人知传播病毒除了在动物宿主中再次发生进化外，两位研究作者认为，病毒的一些关键变异也有可能再次发生在人群“不为人知传播”阶段。

具体来说，就是当病毒最初传遍人身上时，由于无症状感染者没能被找到，病毒在人传人过程中逐步演化出了上述蛋白酶切割成位点等关键变异，从而显得几乎适应环境于人类。因为无法回避这种有可能，作者指出，一方面追溯跟踪2019年12月之前呼吸道症状患者的样本，也许有助取得不为人知传播的信息；另一方面也提醒，在目前大范围传播的情况下，有适当持续注目引发表型变化的病毒变异。

结论在文章的最后，两位研究作者得出了十分最重要的结论：“鉴于野生动物中病毒的多样性以及它们的持续演化，可以说道，要减少未来的愈演愈烈风险，最简单也是最不具成本效益的方法是尽量容许我们对动物病原体的认识。尽管我们与动物世界的密切关系意味著不有可能创建几乎堵塞的壁垒，但是，针对非法野生动植物贸易采行更加强有力的行动，杜绝湿货市场中所有的哺乳类野生动物交易，将获取最重要的缓冲器。

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